Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TFIP11Q9UBB9 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms