Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
USP35Q9P2H5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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