Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CNTN3Q9P232 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CNTN3Q9P232 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms