Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC180Q9P1Z9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC29.33■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC180Q9P1Z9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms