Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHST12Q9NRB3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CHST12Q9NRB3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms