Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PFDN4Q9NQP4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PFDN4Q9NQP4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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