Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms