Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT17Q9BSW7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms