Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM175Q9BSA9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM175Q9BSA9 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms