Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SRSF8Q9BRL6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms