Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGIP1Q9BQI5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms