Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PITX2Q99697 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PITX2Q99697 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms