Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCNAQ96QF7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCNAQ96QF7 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms