Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRIQ1Q96JM4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms