Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
COG3Q96JB2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms