Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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ECHDC3Q96DC8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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