Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms