Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC12Q8WUD4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms