Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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UBA3Q8TBC4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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