Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC112Q8NEF3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms