Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CLDN19Q8N6F1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CLDN19Q8N6F1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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