Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms