Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMARCD3Q6STE5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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