Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
DUX4L9Q6RFH8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms