Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ZNF549Q6P9A3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF549Q6P9A3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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