Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 EGFR-AS1-201ENST00000442411 2806 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPY1Q3B7I2 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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