Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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