Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CA9Q16790 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms