Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CLPPQ16740 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLPPQ16740 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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