Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD2Q16342 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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