Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ATP6AP1Q15904 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms