Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
USF2Q15853 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
USF2Q15853 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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