Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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NCOA1Q15788 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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NCOA1Q15788 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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NCOA1Q15788 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCOA1Q15788 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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NCOA1Q15788 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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NCOA1Q15788 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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NCOA1Q15788 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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NCOA1Q15788 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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