Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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