Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CDSNQ15517 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CDSNQ15517 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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CDSNQ15517 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
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CDSNQ15517 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CDSNQ15517 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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