Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SKIV2LQ15477 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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