Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TLR1Q15399 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms