Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HERC3Q15034 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HERC3Q15034 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HERC3Q15034 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HERC3Q15034 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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HERC3Q15034 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HERC3Q15034 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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