Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KCNB1Q14721 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KCNB1Q14721 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms