Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TRIM25Q14258 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms