Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMB3Q13751 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms