Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CACNA1SQ13698 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
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