Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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