Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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