Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LSAMPQ13449 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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LSAMPQ13449 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LSAMPQ13449 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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