Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 DUTP8-201ENST00000418412 489 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SCARNA7-201ENST00000458797 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC027644.3-201ENST00000607978 557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ARL9-201ENST00000360096 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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