Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PMS2P3Q13401 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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