Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDCLQ13371 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDCLQ13371 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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