Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CHAF1BQ13112 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHAF1BQ13112 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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CHAF1BQ13112 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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