Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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IFT88Q13099 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IFT88Q13099 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IFT88Q13099 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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